TY - JOUR AU - Littlechild, J. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Thermophilic archaeal enzymes and applications in biocatalysis JO - Biochem Soc Trans VL - 39 UR - https://doi.org/10.1042/BST0390155 DO - 10.1042/BST0390155 ID - Littlechild2011 ER - TY - JOUR AU - Schiraldi, C. AU - Rosa, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - The production of biocatalysts and biomolecules from extremophiles JO - Trends Biotechnol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/S0167-7799(02)02073-5 DO - 10.1016/S0167-7799(02)02073-5 ID - Schiraldi2002 ER - TY - JOUR AU - Vieille, C. AU - Zeikus, G. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Hyperthermophilic enzymes: sources, uses, and molecular mechanisms for thermostability JO - Microbiol Mol Biol R VL - 65 UR - https://doi.org/10.1128/MMBR.65.1.1-43.2001 DO - 10.1128/MMBR.65.1.1-43.2001 ID - Vieille2001 ER - TY - JOUR AU - Koga, Y. AU - Tanaka, S. -. I. AU - Sakudo, A. AU - Tobiume, M. AU - Aranishi, M. AU - Hirata, A. AU - Takano, K. AU - Ikuta, K. AU - Kanaya, S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Proteolysis of abnormal prion protein with a thermostable protease from Thermococcus kodakarensis KOD1 JO - Appl Microbiol Biot VL - 98 UR - https://doi.org/10.1007/s00253-013-5091-7 DO - 10.1007/s00253-013-5091-7 ID - Koga2014 ER - TY - JOUR AU - Singh, R. AU - Kumar, M. AU - Mittal, A. AU - Mehta, P. K. PY - 2016 DA - 2016// TI - Microbial enzymes: industrial progress in 21st century JO - 3 Biotech VL - 6 UR - https://doi.org/10.1007/s13205-016-0485-8 DO - 10.1007/s13205-016-0485-8 ID - Singh2016 ER - TY - JOUR AU - Šnajder, M. AU - Vilfan, T. AU - Černilec, M. AU - Rupreht, R. AU - Popović, M. AU - Juntes, P. AU - Šerbec, V. Č. AU - Ulrih, N. P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Enzymatic degradation of PrPSc by a protease secreted from Aeropyrum pernix K1 JO - PLoS ONE VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039548 DO - 10.1371/journal.pone.0039548 ID - Šnajder2012 ER - TY - JOUR AU - Šnajder, M. AU - Mihelič, M. AU - Turk, D. AU - Ulrih, N. P. PY - 2015 DA - 2015// TI - Codon optimisation is key for pernisine expression in Escherichia coli JO - PLoS ONE VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0123288 DO - 10.1371/journal.pone.0123288 ID - Šnajder2015 ER - TY - JOUR AU - Tanaka, S. AU - Takeuchi, Y. AU - Matsumura, H. AU - Koga, Y. AU - Takano, K. AU - Kanaya, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Crystal structure of Tk-subtilisin folded without propeptide: requirement of propeptide for acceleration of folding JO - FEBS Lett VL - 582 UR - https://doi.org/10.1016/j.febslet.2008.10.025 DO - 10.1016/j.febslet.2008.10.025 ID - Tanaka2008 ER - TY - JOUR AU - Carrillo Rincón, A. F. AU - Magdevska, V. AU - Kranjc, L. AU - Fujs, Š. AU - Müller, R. AU - Petković, H. PY - 2018 DA - 2018// TI - Production of extracellular heterologous proteins in Streptomyces rimosus, producer of the antibiotic oxytetracycline JO - Appl Microbiol Biot VL - 102 UR - https://doi.org/10.1007/s00253-018-8793-z DO - 10.1007/s00253-018-8793-z ID - Carrillo Rincón2018 ER - TY - JOUR AU - Anné, J. AU - Vrancken, K. AU - Mellaert, L. AU - Impe, J. AU - Bernaerts, K. PY - 2014 DA - 2014// TI - Protein secretion biotechnology in Gram-positive bacteria with special emphasis on Streptomyces lividans JO - Biochim Biophys Acta (BBA). VL - 1843 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2013.12.023 DO - 10.1016/j.bbamcr.2013.12.023 ID - Anné2014 ER - TY - JOUR AU - Petković, H. AU - Cullum, J. AU - Hranueli, D. AU - Hunter, I. S. AU - Perić-Concha, N. AU - Pigac, J. AU - Thamchaipenet, A. AU - Vujaklija, D. AU - Long, P. F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genetics of Streptomyces rimosus, the oxytetracycline producer JO - Microbiol Mol Biol R VL - 70 UR - https://doi.org/10.1128/MMBR.00004-06 DO - 10.1128/MMBR.00004-06 ID - Petković2006 ER - TY - JOUR AU - Gullón, S. AU - Marín, S. AU - Mellado, R. P. PY - 2015 DA - 2015// TI - Overproduction of a model Sec- and Tat-dependent secretory protein elicits different cellular responses in Streptomyces lividans JO - PLoS ONE VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0133645 DO - 10.1371/journal.pone.0133645 ID - Gullón2015 ER - TY - JOUR AU - Morosoli, R. AU - Shareck, F. AU - Kluepfel, D. PY - 1997 DA - 1997// TI - Protein secretion in streptomycetes JO - FEMS Microbiol Lett VL - 146 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1997.tb10188.x DO - 10.1111/j.1574-6968.1997.tb10188.x ID - Morosoli1997 ER - TY - JOUR AU - Pethick, F. E. AU - MacFadyen, A. C. AU - Tang, Z. AU - Sangal, V. AU - Liu, T. -. T. AU - Chu, J. AU - Kosec, G. AU - Petkovic, H. AU - Guo, M. AU - Kirby, R. PY - 2013 DA - 2013// TI - Draft genome sequence of the oxytetracycline-producing bacterium Streptomyces rimosus ATCC 10970 JO - Genome Announc VL - 1 UR - https://doi.org/10.1128/genomeA.00063-13 DO - 10.1128/genomeA.00063-13 ID - Pethick2013 ER - TY - JOUR AU - Roosmalen, M. L. AU - Geukens, N. AU - Jongbloed, J. D. H. AU - Tjalsma, H. AU - Dubois, J. Y. F. AU - Bron, S. AU - Dijl, J. M. AU - Anné, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Type I signal peptidases of gram-positive bacteria JO - Biochim Biophys Acta (BBA). VL - 1694 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2004.05.006 DO - 10.1016/j.bbamcr.2004.05.006 ID - Roosmalen2004 ER - TY - JOUR AU - Tanaka, S. -. I. AU - Matsumura, H. AU - Koga, Y. AU - Takano, K. AU - Kanaya, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Identification of the interactions critical for propeptide-catalyzed folding of Tk-Subtilisin JO - J Mol Biol VL - 394 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2009.09.028 DO - 10.1016/j.jmb.2009.09.028 ID - Tanaka2009 ER - TY - JOUR AU - Catara, G. AU - Ruggiero, G. AU - Cara, F. AU - Digilio, F. A. AU - Capasso, A. AU - Rossi, M. PY - 2003 DA - 2003// TI - A novel extracellular subtilisin-like protease from the hyperthermophile Aeropyrum pernix K1: biochemical properties, cloning, and expression JO - Extremophiles VL - 7 UR - https://doi.org/10.1007/s00792-003-0337-4 DO - 10.1007/s00792-003-0337-4 ID - Catara2003 ER - TY - JOUR AU - Tanaka, S. AU - Matsumura, H. AU - Koga, Y. AU - Takano, K. AU - Kanaya, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Four new crystal structures of Tk-subtilisin in unautoprocessed, autoprocessed and mature forms: insight into structural changes during maturation JO - J Mol Biol VL - 372 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2007.07.027 DO - 10.1016/j.jmb.2007.07.027 ID - Tanaka2007 ER - TY - JOUR AU - Shirai, A. AU - Matsuyama, A. AU - Yashiroda, Y. AU - Hashimoto, A. AU - Kawamura, Y. AU - Arai, R. AU - Komatsu, Y. AU - Horinouchi, S. AU - Yoshida, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Global analysis of gel mobility of proteins and its use in target identification JO - J Biol Chem VL - 283 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M709211200 DO - 10.1074/jbc.M709211200 ID - Shirai2008 ER - TY - JOUR AU - Gentile, F. AU - Amodeo, P. AU - Febbraio, F. AU - Picaro, F. AU - Motta, A. AU - Formisano, S. AU - Nucci, R. PY - 2002 DA - 2002// TI - SDS-resistant active and thermostable dimers are obtained from the dissociation of homotetrameric β-Glycosidase from hyperthermophilic Sulfolobus solfataricus in SDS: stabilizing role of the A–C intermonomeric interface JO - J Biol Chem VL - 277 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M206761200 DO - 10.1074/jbc.M206761200 ID - Gentile2002 ER - TY - JOUR AU - Pulido, M. AU - Saito, K. AU - Tanaka, S. AU - Koga, Y. AU - Morikawa, M. AU - Takano, K. AU - Kanaya, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Ca2+-dependent maturation of subtilisin from a hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakaraensis: the propeptide is a potent inhibitor of the mature domain but is not required for its folding JO - Appl Environ Microbiol VL - 72 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02696-05 DO - 10.1128/AEM.02696-05 ID - Pulido2006 ER - TY - JOUR AU - Okoroma, E. A. AU - Purchase, D. AU - Garelick, H. AU - Morris, R. AU - Neale, M. H. AU - Windl, O. AU - Abiola, O. O. PY - 2013 DA - 2013// TI - Enzymatic formulation capable of degrading scrapie prion under mild digestion conditions JO - PLoS ONE VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0068099 DO - 10.1371/journal.pone.0068099 ID - Okoroma2013 ER - TY - STD TI - Ulrih NP, Vilfan T. Compositions and methods for degradation of protein deposites and prions: European Patent Application: EP 2 311 323 A1. Europäisches Patentamt; 2011. ID - ref23 ER - TY - JOUR AU - MacNeil, D. J. AU - Gewain, K. M. AU - Ruby, C. L. AU - Dezeny, G. AU - Gibbons, P. H. AU - MacNeil, T. PY - 1992 DA - 1992// TI - Analysis of Streptomyces avermitilis genes required for avermectin biosynthesis utilizing a novel integration vector JO - Gene VL - 111 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(92)90603-M DO - 10.1016/0378-1119(92)90603-M ID - MacNeil1992 ER - TY - JOUR AU - Pigac, J. AU - Schrempf, H. PY - 1995 DA - 1995// TI - A simple and rapid method of transformation of Streptomyces rimosus R6 and other streptomycetes by electroporation JO - Appl Environ Microbiol VL - 61 ID - Pigac1995 ER - TY - BOOK AU - Kieser, T. AU - Bibb, M. J. AU - Buttner, M. J. AU - Chater, K. F. AU - Hopwood, D. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Practical streptomyces genetics PB - John Innes Foundation CY - New York ID - Kieser2000 ER - TY - JOUR AU - Hodgson, D. A. PY - 1982 DA - 1982// TI - Glucose repression of carbon source uptake and metabolism in Streptomyces coelicolor A3(2) and its perturbation in mutants resistant to 2-deoxyglucose JO - Microbiology VL - 128 UR - https://doi.org/10.1099/00221287-128-10-2417 DO - 10.1099/00221287-128-10-2417 ID - Hodgson1982 ER - TY - JOUR AU - Hranueli, D. AU - Pigac, J. AU - Vešligaj, M. PY - 1979 DA - 1979// TI - Characterization and persistence of actinophage RP2 isolated from Streptomyces rimosus ATCC 10970 JO - Microbiology VL - 114 ID - Hranueli1979 ER - TY - JOUR AU - Papadopoulos, J. S. AU - Agarwala, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - COBALT: constraint-based alignment tool for multiple protein sequences JO - Bioinformation VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm076 DO - 10.1093/bioinformatics/btm076 ID - Papadopoulos2007 ER - TY - JOUR AU - Finn, R. D. AU - Attwood, T. K. AU - Babbitt, P. C. AU - Bateman, A. AU - Bork, P. AU - Bridge, A. J. AU - Chang, H. -. Y. AU - Dosztányi, Z. AU - El-Gebali, S. AU - Fraser, M. PY - 2017 DA - 2017// TI - InterPro in 2017—beyond protein family and domain annotations JO - Nucleic Acids Res VL - 45 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkw1107 DO - 10.1093/nar/gkw1107 ID - Finn2017 ER - TY - JOUR AU - Biasini, M. AU - Bienert, S. AU - Waterhouse, A. AU - Arnold, K. AU - Studer, G. AU - Schmidt, T. AU - Kiefer, F. AU - Cassarino, T. G. AU - Bertoni, M. AU - Bordoli, L. AU - Schwede, T. PY - 2014 DA - 2014// TI - SWISS-MODEL: modelling protein tertiary and quaternary structure using evolutionary information JO - Nucleic Acids Res VL - 42 ID - Biasini2014 ER - TY - JOUR AU - Provencher, S. W. PY - 1982 DA - 1982// TI - CONTIN: a general purpose constrained regularization program for inverting noisy linear algebraic and integral equations JO - Comput Phys Comm VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/0010-4655(82)90174-6 DO - 10.1016/0010-4655(82)90174-6 ID - Provencher1982 ER -