TY - JOUR AU - Chen, C. AU - Si, S. AU - He, Q. AU - Xu, H. AU - Lu, M. AU - Xie, Y. AU - Wang, Y. AU - Chen, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Isolation and characterization of antibiotic NC0604, a new analogue of bleomycin JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 61 UR - https://doi.org/10.1038/ja.2008.88 DO - 10.1038/ja.2008.88 ID - Chen2008 ER - TY - JOUR AU - Ren, H. AU - Lu, M. AU - Xie, Y. Y. AU - Gao, N. AU - Xu, H. Z. AU - Yao, T. E. AU - He, N. AU - He, Q. Y. AU - Chen, R. X. PY - 2012 DA - 2012// TI - NC1101, a novel tetrahydropyrimidine-containing bleomycin analog from Streptomyces verticillus var. pingyangensis n. var JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 65 UR - https://doi.org/10.1038/ja.2012.23 DO - 10.1038/ja.2012.23 ID - Ren2012 ER - TY - JOUR AU - Qi, X. AU - Wang, X. AU - Ren, H. AU - Zhang, F. AU - Zhang, X. AU - He, N. AU - Guo, W. AU - Chen, R. AU - Xie, Y. AU - He, Q. PY - 2017 DA - 2017// TI - NC1404, a novel derivative of Bleomycin with modified sugar moiety obtained during the preparation of Boningmycin JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 70 UR - https://doi.org/10.1038/ja.2017.63 DO - 10.1038/ja.2017.63 ID - Qi2017 ER - TY - JOUR AU - Arai, M. AU - Haneishi, T. AU - Kitahara, N. AU - Enokita, R. AU - Kawakubo, K. PY - 1976 DA - 1976// TI - Herbicidins A and B, two new antibiotics with herbicidal activity. I. Producing organism and biological activities JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 29 UR - https://doi.org/10.7164/antibiotics.29.863 DO - 10.7164/antibiotics.29.863 ID - Arai1976 ER - TY - JOUR AU - Haneishi, T. AU - Terahara, A. AU - Kayamori, H. AU - Yabe, J. AU - Arai, M. PY - 1976 DA - 1976// TI - Herbicidins A and B, two new antibiotics with herbicidal activity. II. Fermentation, isolation and physico-chemical characterization JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 29 UR - https://doi.org/10.7164/antibiotics.29.870 DO - 10.7164/antibiotics.29.870 ID - Haneishi1976 ER - TY - JOUR AU - Takiguchi, Y. AU - Yoshikawa, H. AU - Terahara, A. AU - Torikata, A. AU - Terao, M. PY - 1979 DA - 1979// TI - Herbicidins F and G, two new nucleoside antibiotics JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 32 UR - https://doi.org/10.7164/antibiotics.32.862 DO - 10.7164/antibiotics.32.862 ID - Takiguchi1979 ER - TY - JOUR AU - Takiguchi, Y. AU - Yoshikawa, H. AU - Terahara, A. AU - Torikata, A. AU - Terao, M. PY - 1979 DA - 1979// TI - Herbicidins C and E, two new necleoside antibiotics JO - J Antibiot (Tokyo) VL - 32 UR - https://doi.org/10.7164/antibiotics.32.857 DO - 10.7164/antibiotics.32.857 ID - Takiguchi1979 ER - TY - JOUR AU - Chai, X. AU - Youn, U. J. AU - Sun, D. AU - Dai, J. AU - Williams, P. AU - Kondratyuk, T. P. AU - Borris, R. P. AU - Davies, J. AU - Villanueva, I. G. AU - Pezzuto, J. M. AU - Chang, L. C. PY - 2014 DA - 2014// TI - Herbicidin congeners, undecose nucleosides from an organic extract of Streptomyces sp. L-9-10 JO - J Nat Prod VL - 77 UR - https://doi.org/10.1021/np4006635 DO - 10.1021/np4006635 ID - Chai2014 ER - TY - JOUR AU - Ha, S. AU - Lee, K. J. AU - Lee, S. I. AU - Gwak, H. J. AU - Lee, J. H. AU - Kim, T. W. AU - Choi, H. J. AU - Jang, J. Y. AU - Choi, J. S. AU - Kim, C. J. PY - 2017 DA - 2017// TI - Optimization of Herbicidin A Production in Submerged Culture of Streptomyces scopuliridis M40 JO - J Microbiol Biotechnol VL - 27 UR - https://doi.org/10.4014/jmb.1611.11005 DO - 10.4014/jmb.1611.11005 ID - Ha2017 ER - TY - JOUR AU - Chen, J. J. AU - Rateb, M. E. AU - Love, M. S. AU - Xu, Z. AU - Yang, D. AU - Zhu, X. AU - Huang, Y. AU - Zhao, L. X. AU - Jiang, Y. AU - Duan, Y. PY - 2018 DA - 2018// TI - Herbicidins from Streptomyces sp. CB01388 showing anti-Cryptosporidium activity JO - J Nat Prod VL - 81 UR - https://doi.org/10.1021/acs.jnatprod.7b00850 DO - 10.1021/acs.jnatprod.7b00850 ID - Chen2018 ER - TY - STD TI - Tang GL, Li WT, Pan HX, Jian XH: The biosynthetic gene cluster of aureonucleomycin and its application. Chinese Patent, CN201210236348.1. 2012 (in Chinese). ID - ref11 ER - TY - JOUR AU - Pan, H. X. AU - Chen, Z. AU - Zeng, T. AU - Jin, W. B. AU - Geng, Y. AU - Lin, G. M. AU - Zhao, J. AU - Li, W. T. AU - Xiong, Z. AU - Huang, S. X. PY - 2019 DA - 2019// TI - Elucidation of the herbicidin tailoring pathway offers insights into its structural diversity JO - Org Lett VL - 21 UR - https://doi.org/10.1021/acs.orglett.9b00066 DO - 10.1021/acs.orglett.9b00066 ID - Pan2019 ER - TY - JOUR AU - Lin, G. M. AU - Romo, A. J. AU - Liem, P. H. AU - Chen, Z. AU - Liu, H. W. PY - 2017 DA - 2017// TI - Identification and interrogation of the herbicidin biosynthetic gene cluster: first insight into the biosynthesis of a rare undecose nucleoside antibiotic JO - J Am Chem Soc VL - 139 UR - https://doi.org/10.1021/jacs.7b08985 DO - 10.1021/jacs.7b08985 ID - Lin2017 ER - TY - JOUR AU - Watrous, J. AU - Roach, P. AU - Alexandrov, T. AU - Heath, B. S. AU - Yang, J. Y. AU - Kersten, R. D. AU - Voort, M. AU - Pogliano, K. AU - Gross, H. AU - Raaijmakers, J. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mass spectral molecular networking of living microbial colonies JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1203689109 DO - 10.1073/pnas.1203689109 ID - Watrous2012 ER - TY - JOUR AU - Quinn, R. A. AU - Nothias, L. F. AU - Vining, O. AU - Meehan, M. AU - Esquenazi, E. AU - Dorrestein, P. C. PY - 2017 DA - 2017// TI - Molecular networking as a drug discovery, drug metabolism, and precision medicine strategy JO - Trends Pharmacol Sci VL - 38 UR - https://doi.org/10.1016/j.tips.2016.10.011 DO - 10.1016/j.tips.2016.10.011 ID - Quinn2017 ER - TY - JOUR AU - Caesar, L. K. AU - Kellogg, J. J. AU - Kvalheim, O. M. AU - Cech, R. A. AU - Cech, N. B. PY - 2018 DA - 2018// TI - Integration of biochemometrics and molecular networking to identify antimicrobials in Angelica keiskei JO - Planta Med VL - 84 UR - https://doi.org/10.1055/a-0590-5223 DO - 10.1055/a-0590-5223 ID - Caesar2018 ER - TY - JOUR AU - Jiang, Z. B. AU - Ren, W. C. AU - Shi, Y. Y. AU - Li, X. X. AU - Lei, X. AU - Fan, J. H. AU - Zhang, C. AU - Gu, R. J. AU - Wang, L. F. AU - Xie, Y. Y. AU - Hong, B. PY - 2018 DA - 2018// TI - Structure-based manual screening and automatic networking for systematically exploring sansanmycin analogues using high performance liquid chromatography tandem mass spectroscopy JO - J Pharm Biomed Anal VL - 158 UR - https://doi.org/10.1016/j.jpba.2018.05.024 DO - 10.1016/j.jpba.2018.05.024 ID - Jiang2018 ER - TY - JOUR AU - Nothias, L. F. AU - Nothias-Esposito, M. AU - Silva, R. AU - Wang, M. AU - Protsyuk, I. AU - Zhang, Z. AU - Sarvepalli, A. AU - Leyssen, P. AU - Touboul, D. AU - Costa, J. PY - 2018 DA - 2018// TI - Bioactivity-based molecular networking for the discovery of drug leads in natural product bioassay-guided fractionation JO - J Nat Prod VL - 81 UR - https://doi.org/10.1021/acs.jnatprod.7b00737 DO - 10.1021/acs.jnatprod.7b00737 ID - Nothias2018 ER - TY - JOUR AU - Hou, X. M. AU - Li, Y. Y. AU - Shi, Y. W. AU - Fang, Y. W. AU - Chao, R. AU - Gu, Y. C. AU - Wang, C. Y. AU - Shao, C. L. PY - 2019 DA - 2019// TI - Integrating molecular networking and 1H NMR to target the isolation of chrysogeamides from a library of marine-derived Penicillium fungi JO - J Org Chem VL - 84 UR - https://doi.org/10.1021/acs.joc.8b02614 DO - 10.1021/acs.joc.8b02614 ID - Hou2019 ER - TY - JOUR AU - Bierman, M. AU - Logan, R. AU - O’Brien, K. AU - Seno, E. T. AU - Rao, R. N. AU - Schoner, B. E. PY - 1992 DA - 1992// TI - Plasmid cloning vectors for the conjugal transfer of DNA from Escherichia coli to Streptomyces spp JO - Gene VL - 116 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(92)90627-2 DO - 10.1016/0378-1119(92)90627-2 ID - Bierman1992 ER - TY - JOUR AU - Hong, B. AU - Phornphisutthimas, S. AU - Tilley, E. AU - Baumberg, S. AU - McDowall, K. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Streptomycin production by Streptomyces griseus can be modulated by a mechanism not associated with change in the adpA component of the A-factor cascade JO - Biotechnol Lett VL - 29 UR - https://doi.org/10.1007/s10529-006-9216-2 DO - 10.1007/s10529-006-9216-2 ID - Hong2007 ER - TY - JOUR AU - Robert, X. AU - Gouet, P. PY - 2014 DA - 2014// TI - Deciphering key features in protein structures with the new ENDscript server JO - Nucleic Acids Res VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gku316 DO - 10.1093/nar/gku316 ID - Robert2014 ER - TY - JOUR AU - Bailey, T. L. AU - Elkan, C. PY - 1994 DA - 1994// TI - Fitting a mixture model by expectation maximization to discover motifs in biopolymers JO - Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol VL - 2 ID - Bailey1994 ER - TY - JOUR AU - Grant, C. E. AU - Bailey, T. L. AU - Noble, W. S. PY - 2011 DA - 2011// TI - FIMO: scanning for occurrences of a given motif JO - Bioinformatics VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr064 DO - 10.1093/bioinformatics/btr064 ID - Grant2011 ER - TY - JOUR AU - Machanick, P. AU - Bailey, T. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - MEME-ChIP: motif analysis of large DNA datasets JO - Bioinformatics VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr189 DO - 10.1093/bioinformatics/btr189 ID - Machanick2011 ER - TY - JOUR AU - Egland, K. A. AU - Greenberg, E. P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Quorum sensing in Vibrio fischeri: elements of the luxl promoter JO - Mol Microbiol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1999.01261.x DO - 10.1046/j.1365-2958.1999.01261.x ID - Egland1999 ER - TY - JOUR AU - Luo, Z. Q. AU - Farrand, S. K. PY - 1999 DA - 1999// TI - Signal-dependent DNA binding and functional domains of the quorum-sensing activator TraR as identified by repressor activity JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 96 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.96.16.9009 DO - 10.1073/pnas.96.16.9009 ID - Luo1999 ER - TY - JOUR AU - Gray, K. M. AU - Passador, L. AU - Iglewski, B. H. AU - Greenberg, E. P. PY - 1994 DA - 1994// TI - Interchangeability and specificity of components from the quorum-sensing regulatory systems of Vibrio fischeri and Pseudomonas aeruginosa JO - J Bacteriol VL - 176 UR - https://doi.org/10.1128/jb.176.10.3076-3080.1994 DO - 10.1128/jb.176.10.3076-3080.1994 ID - Gray1994 ER - TY - JOUR AU - Lee, J. H. AU - Lequette, Y. AU - Greenberg, E. P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Activity of purified QscR, a Pseudomonas aeruginosa orphan quorum-sensing transcription factor JO - Mol Microbiol VL - 59 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.2005.04960.x DO - 10.1111/j.1365-2958.2005.04960.x ID - Lee2006 ER - TY - JOUR AU - Shannon, P. AU - Markiel, A. AU - Ozier, O. AU - Baliga, N. S. AU - Wang, J. T. AU - Ramage, D. AU - Amin, N. AU - Schwikowski, B. AU - Ideker, T. PY - 2003 DA - 2003// TI - Cytoscape: a software environment for integrated models of biomolecular interaction networks JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1239303 DO - 10.1101/gr.1239303 ID - Shannon2003 ER - TY - JOUR AU - Wang, L. AU - Hu, Y. AU - Zhang, Y. AU - Wang, S. AU - Cui, Z. AU - Bao, Y. AU - Jiang, W. AU - Hong, B. PY - 2009 DA - 2009// TI - Role of sgcR3 in positive regulation of enediyne antibiotic C-1027 production of Streptomyces globisporus C-1027 JO - BMC Microbiol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-9-14 DO - 10.1186/1471-2180-9-14 ID - Wang2009 ER - TY - BOOK AU - Kieser, T. AU - Bibb, M. J. AU - Buttner, M. J. AU - Chater, K. F. AU - Hopwood, D. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Practical streptomyces genetics PB - John Innes Foundation CY - Norwich ID - Kieser2000 ER - TY - CHAP AU - Korn, F. AU - Weingartner, B. AU - Kutzner, H. J. ED - Freerksen, E. ED - Tarnok, I. ED - Thumin, H. PY - 1978 DA - 1978// TI - A study of twenty actinophages: morphology, serological relationship and host range BT - Genetics of the actinomycetales PB - Gustav Fisher Verlag CY - New York ID - Korn1978 ER - TY - BOOK AU - Sambrook, J. AU - Russell, D. W. PY - 2001 DA - 2001// TI - Molecular cloning: a laboratory manual PB - Cold Spring Harbor CY - Cold Spring Harbor Laboratory ID - Sambrook2001 ER - TY - JOUR AU - Paget, M. S. AU - Chamberlin, L. AU - Atrih, A. AU - Foster, S. J. AU - Buttner, M. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Evidence that the extracytoplasmic function sigma factor σE is required for normal cell wall structure in Streptomyces coelicolor A3(2) JO - J Bacteriol VL - 181 ID - Paget1999 ER - TY - JOUR AU - Li, R. AU - Zhu, H. AU - Ruan, J. AU - Qian, W. AU - Fang, X. AU - Shi, Z. AU - Li, Y. AU - Li, S. AU - Shan, G. AU - Kristiansen, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - De novo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing JO - Genome Res VL - 20 UR - https://doi.org/10.1101/gr.097261.109 DO - 10.1101/gr.097261.109 ID - Li2010 ER - TY - JOUR AU - Blin, K. AU - Wolf, T. AU - Chevrette, M. G. AU - Lu, X. AU - Schwalen, C. J. AU - Kautsar, S. A. AU - Suarez Duran, H. G. AU - Los Santos, E. L. C. AU - Kim, H. U. AU - Nave, M. PY - 2017 DA - 2017// TI - antiSMASH 4.0-improvements in chemistry prediction and gene cluster boundary identification JO - Nucleic Acids Res VL - 45 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkx319 DO - 10.1093/nar/gkx319 ID - Blin2017 ER - TY - JOUR AU - Blin, K. AU - Shaw, S. AU - Steinke, K. AU - Villebro, R. AU - Ziemert, N. AU - Lee, S. Y. AU - Medema, M. H. AU - Weber, T. PY - 2019 DA - 2019// TI - antiSMASH 5.0: updates to the secondary metabolite genome mining pipeline JO - Nucleic Acids Res VL - 47 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkz310 DO - 10.1093/nar/gkz310 ID - Blin2019 ER -