Skip to main content

Table 1 Homology comparison between Gum proteins of K. baliensis DSM 14400 and Gum proteins of HePS biosynthesis related bacteria

From: Dissection of exopolysaccharide biosynthesis in Kozakia baliensis

Kozakia baliensis DSM 14400 Kozakia baliensis NBRC 16680 Gluconacetobacter diazotrophicus PAI 5 Komagataeibacter xylinus E25 Xanthomonas campestris str. ATCC 33913
Protein Protein sequence identities & query cover Protein sequence identities & query cover Protein sequence identities & query cover Protein sequence identities & query cover
GumJ A0U89_05160;502aa 498/502 (99 %); 100 % A0U90_06730 “GumJ” 322/510 (63 %); 98 % GDI2535 “GumJ”   102/456 (22 %); 96 % XCC2446 GumJ
GumE A0U89_05140;416aa 410/416 (99 %); 100 % A0U90_06750 “GumE” 226/393 (58 %); 94 % GDI2538 “GumE” 203/411 (49 %); 98 % H845_814 “GumE” 96/332 (29 %); 74 % XCC2451 GumE
GumK A0U89_05135;373aa 370/373 (99 %); 100 % A0U90_06755 “GumK” 244/369 (66 %); 98 % GDI2542 “GumK” 244/369 (66 %); 98 % H845_816 “GumK” 162/369 (44 %); 91 % XCC2445 GumK
GumD A0U89_05095;420aa 414/420 (99 %); 100 % A0U90_06795 “GumD” 239/420 (57 %); 100 % GDI2547 “GumD” 234/474 (49 %); 94 % H845_822 “AceA” (Griffin,1994) 159/486 (33 %); 96 % XCC2452 GumD
GumM A0U89_05090;271aa 268/271 (99 %); 100 % A0U90_06800 “GumM” 175/253 (69 %); 92 % GDI2548 “GumM” 137/248 (55 %); 91 % H845_823 “ORF3” (Griffin,1994) 66/230 (29 %); 85 % XCC2443 GumM
GumC A0U89_05085;722aa 716/722 (99 %); 100 % A0U90_06805 “GumC” 351/708 (50 %); 97 % GDI_2549 “GumC” 319/709 (45 %); 95 % H845_824 “ORF4” (Griffin,1994) 111/446 (25 %); 95 % XCC2453 GumC
GumH A0U89_05080;341aa 332/341 (99 %); 100 % A0U90_06810 “GumH” 223/370 (60 %); 98 % GDI2550 “GumH” 190/341 (56 %); 99 % H845_825 “AceC” (Griffin,1994) 162/372 (44 %); 97 % XCC2448 GumH
GumB A0U89_05070;189aa 189/189 (99 %); 100 % A0U90_06820 “GumB” 107/179 (60 %); 94 % GDI2552 “GumB” 102/183 (56 %); 95 % H845_828 “GumB” 50/145 (34 %); 66 % XCC2454 GumB