Skip to main content

Advertisement

Table 3 Ranking of the most abundant downregulated sRNAs in Mn-9OHAD/CC, Mn-ADD/CC, and Mn-BNA/CC

From: RNA-Seq analysis uncovers non-coding small RNA system of Mycobacterium neoaurum in the metabolism of sterols to accumulate steroid intermediates

Mn-9OHAD/CC Mn-ADD/CC Mn-BNA/CC
SRNA ID Fold changea SRNA ID Fold change SRNA ID Fold change
160 0 160 0 160 0
102 0 47 0 37 0
184 0 88 0 236 0
8 0 60 0 60 0
111 0 221 0 42 0
225 0 223 0 8 0.10
151 0 75 0 121 0.10
165 0 65 0.04 127 0.11
33 0 210 0.07 94 0.12
233 0 209 0.08 65 0.12
187 0 172 0.11 108 0.14
17 0 46 0.13 142 0.15
73 0 174 0.13 196 0.15
57 0 101 0.13 260 0.15
100 0 27 0.14 151 0.15
75 0 167 0.14 152 0.16
108 0.05 91 0.15 122 0.17
209 0.06 243 0.15 115 0.18
178 0.07 127 0.16 235 0.19
10 0.08 225 0.17 174 0.20
190 0.11 14 0.19 85 0.20
128 0.12 207 0.19 111 0.20
130 0.14 246 0.20 209 0.20
116 0.15 166 0.20 9 0.20
114 0.17 164 0.20 164 0.21
13 0.16 41 0.21 205 0.21
250 0.16 13 0.21 13 0.22
170 0.19 190 0.21 228 0.22
121 0.19 149 0.21 250 0.22
129 0.19 250 0.21 70 0.22
168 0.19 235 0.23 210 0.23
246 0.20 122 0.25 120 0.24
152 0.22 70 0.26 97 0.24
192 0.23 89 0.26 14 0.24
260 0.23 39 0.27 88 0.24
47 0.23 161 0.28 89 0.24
67 0.23 120 0.30 41 0.26
166 0.24 97 0.30 172 0.26
174 0.24 67 0.30 198 0.26
  1. a The RPKM ratio of sRNA candidate expressed in the form of Mn-9OHAD/CC, Mn-ADD/CC, and Mn-BNA/CC