Skip to main content

Table 3 Ranking of the most abundant downregulated sRNAs in Mn-9OHAD/CC, Mn-ADD/CC, and Mn-BNA/CC

From: RNA-Seq analysis uncovers non-coding small RNA system of Mycobacterium neoaurum in the metabolism of sterols to accumulate steroid intermediates

Mn-9OHAD/CC

Mn-ADD/CC

Mn-BNA/CC

SRNA ID

Fold changea

SRNA ID

Fold change

SRNA ID

Fold change

160

0

160

0

160

0

102

0

47

0

37

0

184

0

88

0

236

0

8

0

60

0

60

0

111

0

221

0

42

0

225

0

223

0

8

0.10

151

0

75

0

121

0.10

165

0

65

0.04

127

0.11

33

0

210

0.07

94

0.12

233

0

209

0.08

65

0.12

187

0

172

0.11

108

0.14

17

0

46

0.13

142

0.15

73

0

174

0.13

196

0.15

57

0

101

0.13

260

0.15

100

0

27

0.14

151

0.15

75

0

167

0.14

152

0.16

108

0.05

91

0.15

122

0.17

209

0.06

243

0.15

115

0.18

178

0.07

127

0.16

235

0.19

10

0.08

225

0.17

174

0.20

190

0.11

14

0.19

85

0.20

128

0.12

207

0.19

111

0.20

130

0.14

246

0.20

209

0.20

116

0.15

166

0.20

9

0.20

114

0.17

164

0.20

164

0.21

13

0.16

41

0.21

205

0.21

250

0.16

13

0.21

13

0.22

170

0.19

190

0.21

228

0.22

121

0.19

149

0.21

250

0.22

129

0.19

250

0.21

70

0.22

168

0.19

235

0.23

210

0.23

246

0.20

122

0.25

120

0.24

152

0.22

70

0.26

97

0.24

192

0.23

89

0.26

14

0.24

260

0.23

39

0.27

88

0.24

47

0.23

161

0.28

89

0.24

67

0.23

120

0.30

41

0.26

166

0.24

97

0.30

172

0.26

174

0.24

67

0.30

198

0.26

  1. a The RPKM ratio of sRNA candidate expressed in the form of Mn-9OHAD/CC, Mn-ADD/CC, and Mn-BNA/CC