TY - CHAP AU - Walter, J. AU - Britton, R. A. AU - Roos, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Microbes and Health Sackler Colloquium: Host-microbial symbiosis in the vertebrate gastrointestinal tract and the Lactobacillus reuteri paradigm BT - Proc Natl Acad Sci U S A ID - Walter2010 ER - TY - JOUR AU - Chen, P. AU - Ailion, M. AU - Bobik, T. AU - Stormo, G. AU - Roth, J. PY - 1995 DA - 1995// TI - Five promoters integrate control of the cob/pdu regulon in Salmonella typhimurium JO - Journal of bacteriology VL - 177 ID - Chen1995 ER - TY - JOUR AU - Daniel, R. AU - Bobik, T. A. AU - Gottschalk, G. PY - 1998 DA - 1998// TI - Biochemistry of coenzyme B12-dependent glycerol and diol dehydratases and organization of the encoding genes JO - FEMS microbiology reviews VL - 22 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.1998.tb00387.x DO - 10.1111/j.1574-6976.1998.tb00387.x ID - Daniel1998 ER - TY - JOUR AU - Vollenweider, S. AU - Grassi, G. AU - König, I. AU - Puhan, Z. PY - 2003 DA - 2003// TI - Purification and structural characterization of 3-hydroxypropionaldehyde and its derivatives JO - Journal of agricultural and food chemistry VL - 51 UR - https://doi.org/10.1021/jf021086d DO - 10.1021/jf021086d ID - Vollenweider2003 ER - TY - JOUR AU - Spinler, J. K. AU - Taweechotipatr, M. AU - Rognerud, C. L. AU - Ou, C. N. AU - Tumwasorn, S. AU - Versalovic, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Human-derived probiotic Lactobacillus reuteri demonstrate antimicrobial activities targeting diverse enteric bacterial pathogens JO - Anaerobe VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.anaerobe.2008.02.001 DO - 10.1016/j.anaerobe.2008.02.001 ID - Spinler2008 ER - TY - JOUR AU - Cleusix, V. AU - Lacroix, C. AU - Vollenweider, S. AU - Duboux, M. AU - Le Blay, G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Inhibitory activity spectrum of reuterin produced by Lactobacillus reuteri against intestinal bacteria JO - BMC microbiology VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-7-101 DO - 10.1186/1471-2180-7-101 ID - Cleusix2007 ER - TY - JOUR AU - Santos, F. AU - Vera, J. L. AU - van der Heijden, R. T. J. M. AU - Valdez, G. F. AU - de Vos, W. M. AU - Sesma, F. AU - Hugenholtz, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - The complete coenzyme B12 biosynthesis gene cluster of Lactobacillus reuteri CRL1098 JO - Microbiology VL - 154 UR - https://doi.org/10.1099/mic.0.2007/011569-0 DO - 10.1099/mic.0.2007/011569-0 ID - Santos2008 ER - TY - JOUR AU - Morita, H. AU - Toh, H. AU - Fukuda, S. AU - Horikawa, H. AU - Oshima, K. AU - Suzuki, T. AU - Murakami, M. AU - Hisamatsu, S. AU - Kato, Y. AU - Takizawa, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Comparative genome analysis of Lactobacillus reuteri and Lactobacillus fermentum reveal a genomic island for reuterin and cobalamin production JO - DNA res VL - 15 UR - https://doi.org/10.1093/dnares/dsn009 DO - 10.1093/dnares/dsn009 ID - Morita2008 ER - TY - JOUR AU - Sriramulu, D. D. AU - Liang, M. AU - Hernandez-Romero, D. AU - Raux-Deery, E. AU - Lünsdorf, H. AU - Parsons, J. B. AU - Warren, M. J. AU - Prentice, M. B. PY - 2008 DA - 2008// TI - Lactobacillus reuteri DSM 20016 produces cobalamin-dependent diol dehydratase in metabolosomes and metabolizes 1,2-propanediol by disproportionation JO - Journal of bacteriology VL - 190 UR - https://doi.org/10.1128/JB.01535-07 DO - 10.1128/JB.01535-07 ID - Sriramulu2008 ER - TY - CHAP AU - Santos, F. PY - 2008 DA - 2008// BT - Vitamin B12 synthesis in Lactobacillus reuteri ID - Santos2008 ER - TY - JOUR AU - Rossell, S. AU - Solem, C. AU - Jensen, P. R. AU - Heijnen, J. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Towards a quantitative prediction of the fluxome from the proteome JO - Metabolic engineering VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/j.ymben.2011.01.010 DO - 10.1016/j.ymben.2011.01.010 ID - Rossell2011 ER - TY - JOUR AU - Jones, S. E. AU - Versalovic, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Probiotic Lactobacillus reuteri biofilms produce antimicrobial and anti-inflammatory factors JO - BMC microbiology VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-9-35 DO - 10.1186/1471-2180-9-35 ID - Jones2009 ER - TY - JOUR AU - Bobik, T. A. AU - Ailion, M. AU - Roth, J. R. PY - 1992 DA - 1992// TI - A single regulatory gene integrates control of vitamin B12 synthesis and propanediol degradation JO - J Bacteriol VL - 174 ID - Bobik1992 ER - TY - JOUR AU - Santos, F. AU - Teusink, B. AU - Molenaar, D. AU - van Heck, M. AU - Wels, M. AU - Sieuwerts, S. AU - de Vos, W. M. AU - Hugenholtz, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Effect of amino acid availability on vitamin B12 production in Lactobacillus reuteri JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 75 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02487-08 DO - 10.1128/AEM.02487-08 ID - Santos2009 ER - TY - JOUR AU - Marchler-Bauer, A. AU - Anderson, J. B. AU - Derbyshire, M. K. AU - DeWeese-Scott, C. AU - Gonzales, N. R. AU - Gwadz, M. AU - Hao, L. AU - He, S. AU - Hurwitz, D. I. AU - Jackson, J. D. AU - Ke, Z. AU - Krylov, D. AU - Lanczycki, C. J. AU - Liebert, C. A. AU - Liu, C. AU - Lu, F. AU - Lu, S. AU - Marchler, G. H. AU - Mullokandov, M. AU - Song, J. S. AU - Thanki, N. AU - Yamashita, R. A. AU - Yin, J. J. AU - Zhang, D. AU - Bryant, S. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - CDD: a conserved domain database for interactive domain family analysis JO - Nucleic acids research VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkl951 DO - 10.1093/nar/gkl951 ID - Marchler-Bauer2007 ER - TY - JOUR AU - Overbeek, R. AU - Larsen, N. AU - Walunas, T. AU - D'Souza, M. AU - Pusch, G. AU - Selkov, E. AU - Liolios, K. AU - Joukov, V. AU - Kaznadzey, D. AU - Anderson, I. AU - Bhattacharyya, A. AU - Burd, H. AU - Gardner, W. AU - Hanke, P. AU - Kapatral, V. AU - Mikhailova, N. AU - Vasieva, O. AU - Osterman, A. AU - Vonstein, V. AU - Fonstein, M. AU - Ivanova, N. AU - Kyrpides, N. PY - 2003 DA - 2003// TI - The ERGO genome analysis and discovery system JO - Nucleic acids research VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg148 DO - 10.1093/nar/gkg148 ID - Overbeek2003 ER - TY - JOUR AU - Wegkamp, A. AU - Mars, A. E. AU - Faijes, M. AU - Molenaar, D. AU - de Vos, R. C. AU - Klaus, S. M. J. AU - Hanson, A. D. AU - de Vos, W. M. AU - Smid, E. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Physiological responses to folate overproduction in Lactobacillus plantarum WCFS1 JO - Microbial cell factories VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2859-9-100 DO - 10.1186/1475-2859-9-100 ID - Wegkamp2010 ER - TY - CHAP AU - Wegkamp, A. PY - 2008 DA - 2008// BT - Modulation of folate production in lactic acid bacteria ID - Wegkamp2008 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Gish, W. AU - Miller, W. AU - Myers, E. W. AU - Lipman, D. J. PY - 1990 DA - 1990// TI - Basic Local Alignment Search Tool JO - Journal of molecular biology VL - 215 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2 DO - 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 ID - Altschul1990 ER - TY - JOUR AU - Thompson, J. AU - Higgins, D. AU - Gibson, T. PY - 1994 DA - 1994// TI - CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix JO - Nucleic acids research VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/nar/22.22.4673 DO - 10.1093/nar/22.22.4673 ID - Thompson1994 ER - TY - JOUR AU - de Man, J. D. AU - Rogosa, M. AU - Sharpe, M. E. PY - 1960 DA - 1960// TI - A medium for the cultivation of lactobacilli JO - J Appl Bact VL - 23 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.1960.tb00188.x DO - 10.1111/j.1365-2672.1960.tb00188.x ID - de Man1960 ER - TY - JOUR AU - Santos, F. AU - Wegkamp, A. AU - Vos WM, d. e. AU - Smid, E. J. AU - Hugenholtz, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - High-level folate production in fermented foods by the B12 producer Lactobacillus reuteri JCM1112 JO - Applied and environmental microbiology VL - 74 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02719-07 DO - 10.1128/AEM.02719-07 ID - Santos2008 ER - TY - JOUR AU - Wegkamp, A. AU - Van Oorschot, W. AU - De Vos, W. M. AU - Smid, E. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Characterization of the role of para-aminobenzoic acid biosynthesis in folate production by Lactococcus lactis JO - Applied and environmental microbiology VL - 73 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02174-06 DO - 10.1128/AEM.02174-06 ID - Wegkamp2007 ER - TY - BOOK AU - Sambrook, J. AU - Russell, D. W. PY - 2001 DA - 2001// TI - Molecular cloning: a laboratory manual PB - Cold Spring Harbor CY - N.Y. Cold Spring Harbor Laboratory Press ID - Sambrook2001 ER - TY - JOUR AU - Walter, J. AU - Heng, N. C. K. AU - Hammes, W. P. AU - Loach, D. M. AU - Tannock, G. W. AU - Hertel, C. PY - 2003 DA - 2003// TI - Identification of Lactobacillus reuteri genes specifically induced in the mouse gastrointestinal tract JO - Applied and environmental microbiology VL - 69 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.69.4.2044-2051.2003 DO - 10.1128/AEM.69.4.2044-2051.2003 ID - Walter2003 ER - TY - JOUR AU - Walter, J. AU - Chagnaud, P. AU - Tannock, G. W. AU - Loach, D. M. AU - Dal Bello, F. AU - Jenkinson, H. F. AU - Hammes, W. P. AU - Hertel, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - A high-molecular-mass surface protein (Lsp) and methionine sulfoxide reductase B (MsrB) contribute to the ecological performance of Lactobacillus reuteri in the murine gut JO - Applied and environmental microbiology VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.2.979-986.2005 DO - 10.1128/AEM.71.2.979-986.2005 ID - Walter2005 ER - TY - JOUR AU - Maguin, E. AU - Duwat, P. AU - Hege, T. AU - Ehrlich, D. AU - Gruss, A. PY - 1992 DA - 1992// TI - New thermosensitive plasmid for gram-positive bacteria JO - Journal of bacteriology VL - 174 ID - Maguin1992 ER - TY - JOUR AU - Fons, M. AU - Hégé, T. AU - Ladiré, M. AU - Raibaud, P. AU - Ducluzeau, R. AU - Maguin, E. PY - 1997 DA - 1997// TI - Isolation and characterization of a plasmid from Lactobacillus fermentum conferring erythromycin resistance JO - Plasmid VL - 37 UR - https://doi.org/10.1006/plas.1997.1290 DO - 10.1006/plas.1997.1290 ID - Fons1997 ER - TY - JOUR AU - van der Vossen, J. M. AU - van der Lelie, D. AU - Venema, G. PY - 1987 DA - 1987// TI - Isolation and characterization of Streptococcus cremoris Wg2-specific promoters JO - Applied and environmental microbiology VL - 53 ID - van der Vossen1987 ER - TY - JOUR AU - Starrenburg, M. J. C. AU - Hugenholtz, J. PY - 1991 DA - 1991// TI - Citrate Fermentation by Lactococcus and Leuconostoc spp JO - Applied and environmental microbiology VL - 57 ID - Starrenburg1991 ER - TY - BOOK AU - Horowitz, W. AU - Latimer, G. W. PY - 2006 DA - 2006// TI - Official methods of analysis of AOAC International PB - Gaithersburg CY - Md. AOAC International ID - Horowitz2006 ER - TY - JOUR AU - Saulnier, D. M. AU - Santos, F. AU - Roos, S. AU - Mistretta, T. AU - Spinler, J. K. AU - Molenaar, D. AU - Teusink, B. AU - Versalovic, J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Exploring metabolic pathway reconstruction and genome-wide expression profiling in Lactobacillus reuteri to define functional probiotic features JO - PLoS ONE VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0018783 DO - 10.1371/journal.pone.0018783 ID - Saulnier2011 ER - TY - JOUR AU - Wall, T. AU - Bath, K. AU - Britton, R. A. AU - Jonsson, H. AU - Versalovic, J. AU - Roos, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - The early response to acid shock in Lactobacillus reuteri involves the ClpL chaperone and a putative cell wall-altering esterase JO - Applied and environmental microbiology VL - 73 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01502-06 DO - 10.1128/AEM.01502-06 ID - Wall2007 ER - TY - JOUR AU - Yang, Y. H. AU - Dudoit, S. AU - Luu, P. AU - Lin, D. M. AU - Peng, V. AU - Ngai, J. AU - Speed, T. P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Normalization for cDNA microarray data: a robust composite method addressing single and multiple slide systematic variation JO - Nucleic acids research VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.4.e15 DO - 10.1093/nar/30.4.e15 ID - Yang2002 ER - TY - JOUR AU - Tatusov, R. L. AU - Galperin, M. Y. AU - Natale, D. A. AU - Koonin, E. V. PY - 2000 DA - 2000// TI - The COG database: a tool for genome-scale analysis of protein functions and evolution JO - Nucleic acids research VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.1.33 DO - 10.1093/nar/28.1.33 ID - Tatusov2000 ER -